Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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