Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG2BQ96BY7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms