Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms