Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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