Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTRT1Q8TDG2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms