Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEMA6DQ8NFY4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms