Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TMIEQ8NEW7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TMIEQ8NEW7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TMIEQ8NEW7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TMIEQ8NEW7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIEQ8NEW7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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