Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms