Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms