Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms