Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms