Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PDZK1Q5T2W1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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