Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP170Q5SW79 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms