Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PERM1Q5SV97 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms