Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms