Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBPF1Q3BBV0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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