Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms