Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL24A1Q17RW2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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