Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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