Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms