Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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