Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RPE65Q16518 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPE65Q16518 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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