Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms