Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LAPTM4AQ15012 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LAPTM4AQ15012 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LAPTM4AQ15012 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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LAPTM4AQ15012 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LAPTM4AQ15012 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LAPTM4AQ15012 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LAPTM4AQ15012 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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