Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNAB1Q14722 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms