Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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