Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TUBB3Q13509 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBB3Q13509 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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