Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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