Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XRCC4Q13426 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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