Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBX3Q13185 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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