Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms