Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHAF1BQ13112 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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