Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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