Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms