Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC1Q08554 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms