Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLEQ07864 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms