Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ARL14-201ENST00000320767 1294 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC006460.1-201ENST00000421437 808 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC00331-201ENST00000446391 376 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TNP2Q05952 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms