Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE3AQ05086 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms