Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms