Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms