Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAP25P60880 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms