Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms