Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms