Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms