Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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