Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CSNK1EP49674 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CSNK1EP49674 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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