Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI2P48788 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms