Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX1P48742 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX1P48742 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX1P48742 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LHX1P48742 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LHX1P48742 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LHX1P48742 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHX1P48742 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms