Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NESP48681 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NESP48681 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NESP48681 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NESP48681 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NESP48681 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms