Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 LINC02078-201ENST00000592718 4237 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 TP63-209ENST00000437221 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 BAP1-201ENST00000296288 3434 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CAPN3-203ENST00000349748 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CELF4-203ENST00000420428 4052 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PCP4P48539 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 BTNL3-201ENST00000342868 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ACSBG2-202ENST00000586696 2739 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AC108058.1-201ENST00000457290 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CIITA-202ENST00000381835 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ANKRD18CP-201ENST00000354752 2980 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MMP2-203ENST00000543485 1978 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 FPR1-201ENST00000304748 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NBPF6-201ENST00000370040 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NBPF4-202ENST00000613157 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CSPG4P10-201ENST00000456932 4817 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 OLFML2B-203ENST00000367940 2685 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PCP4P48539 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CDH5-208ENST00000614547 3779 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PCP4P48539 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms